Die Strecke beginnt im mondänen Ferienort St. Moritz und führt über Chur, er ältesten Stadt der Schweiz, bis nach Zermatt, dem autofreien Kurort am Fuße des Matterhorns. 7 ½ Stunden benötigt der Glacier Express für eine Strecke, die über 291 Brücken, 91 Tunnels und über den Oberalppass führt, der sich auf 2033 m befindet. Dabei führt sie an zahlreichen Sehenswürdigkeiten, wie die Landschaft Graubündens, dem Vierwaldstättesee und dem Wallis mit seinen Gletschern vorbei, über Schluchten und an rauschenden Bergbächen.

Im Jahr 1930 verkehrte der Glacier Express das erste Mal vor Zermatt nach St. Moritz mit 70 Gästen. Er war von Anfang an elektrisch betrieben und lag die Strecke St. Moritz – Zermatt in 11 Stunden zurück. Heute meistert er die gleiche Strecke in 7,5 Stunden, was aber auch am Furka-Basistunnel liegt, der im Jahr 1982 fertig gestellt wurde. Vorher konnte der Glacier Express auch nur im Sommer verkehren, dank des Tunnels sind ihm jedoch keine Grenzen mehr gesetzt und er fährt das ganze Jahr über.

Der Glacier Express fährt durchschnittlich nur 35 km/h. Sehr zur Freude der Gäste, denn schließlich ist der Weg das Ziel.So können die Passagiere die herrliche Natur und die malerischen Dörfer sowie die tiefen Schluchten, die der Zug überquert in vollen Zügen genießen und Problemlos ein paar Fotos schießen. Nicht umsonst wird er auch der „langsamste Schnellzug der Welt“ genannt.

Der höchste Punkt wird bei der Fahrt dann auf 2033 m mit dem Oberalppass erreicht. Die Zahnradlock klinkt sich dabei in Zahnstangen ein, sonst wäre die Steile Steigung nicht zu bewältigen. In Desentis wird dann die Lok gewechselt. Für die Steigungen wird die Lok in eine Zahnradlock gewechselt, ab Zermatt wird diese dann mit einer Adhäsionslok ausgetauscht. Die Loks des Glacier Express sind mit der Silhouette des Matterhorns auf ihrer Seite verziert.

Die Wagen des Glacier Express verfügen über fünf Kategorien. Es gibt bei jedem Zug in der 1. Klasse einrollstuhlgerechtes Abteil mit Behindertentoilette. In diesem Fall verfügen die 1 . Klasse Wagen über 30 normale Sitzplätze, ohne das behindertengerechte Abteil über 36. in der 2. Klasse der die nicht klimatisiert sind, aber in denen die Fenster geöffnet werden können. In diesen konventionellen Wagen können in der 1. Klasse 36 Gäste Platz finden , in der 2. Klasse 56. Alle Infos zur Strecke und Sehenswürdigkeiten sind in allen Wagenkategorien vorhanden. In den Panoramawagen über Kopfhörer, in den normalen Wagen per Lautsprecher. Egal , für welche klasse man sich entscheidet, eine Reservierung ist obligatorisch.

In den Glacier Express Zügen können die Gäste zwischen verschiedenen Verpflegungsmöglichkeiten wählen. In der Bordküche werden die Speisen frisch zubereitet und mit Liebe serviert. So gibt es beispielsweise Service am Sitzplatz, Railbar oder einen Speisewagen. Plätze im Speisewagen müssen reserviert werden, für alle Railbar können kalte Speisen vorbestellt werden.

Im Sommer verkehrt der Glacier Express, anders als im Winter. So ist im Winter die Strecke St. Moritz - Zermatt ohne Umstieg möglich. Von Davos nach Zermatt und umgekehrt muss einmal umgestiegen werden.